El programa “Contraloría Ambiental”, se inicia realizando un taller de inducción sobre educación ambiental para todos los trabajadores activos dictado por especialistas en el tema, seguidamente se postulan los servidores públicos activos que deseen ser el contralor o contralora ambiental y se realiza la elección del mismo. Luego en una jornada ambientalista se realiza la juramentación del contralor o contralora ambiental quien en conjunto con la dirección de atención al ciudadano y control social representaran este Ente de Control Fiscal en cada actividad o jornada ambientalista.

Este programa tiene como objetivo concientizar a la ciudadanía mediante la educación ambiental, para fomentar valores, principios e incentivar a los ciudadanos y ciudadanas a supervisar el buen uso de los recursos de la naturaleza, en otras palabras, el uso correcto de la energía eléctrica, del agua, la conservación del medio ambiente, la reforestación de suelos, así como velar por el cumplimiento de los planes, programas y normas establecidas en materia ambiental dentro de las comunidades a las que pertenecen.